Với hệ thống kênh rạch dày đặc, hàng năm TPHCM tổ chức việc nạo vét, khơi thông các khu vực bị bồi lắng, ô nhiễm để tăng khả năng trữ, thoát nước, đồng thời cải thiện môi trường nước. Tuy nhiên, bùn thải sau nạo vét được xử lý thế nào vẫn là vấn đề nan giải .
