Ngày 17/12/2016, Trường Đại học Cần Thơ (ĐHCT) tổ chức lễ trao bằng cho 9 tân tiến sĩ và 560 tân thạc sĩ. Như vậy, tính đến nay, Đại học Cần Thơ đã đào tạo 83 tiến sĩ và 8.448 thạc sĩ tốt nghiệp bổ sung nguồn nhân lực trình độ cao phục vụ cho ĐBSCL và cả nước.
Từ năm 1982, trường ĐHCT được Bộ Giáo dục và Đào tạo giao nhiệm vụ đào tạo bậc tiến sĩ, với 2 chuyên ngành là Vi sinh vật học và Nông hóa – Thổ nhưỡng. Đến năm 1993, trường triển khai đào tạo cao học khóa đầu tiên, với 4 chuyên ngành: Nông học, Chăn nuôi, Thú y và Sinh thái học.
Trường đang đào tạo 41 chuyên ngành thạc sĩ và 16 chuyên ngành tiến sĩ (trong đó có 1 chuyên ngành đào tạo thí điểm). Quy mô đào tạo sau đại học của trường là 3.848 học viên, trong đó có 387 nghiên cứu sinh và 3.461 học viên cao học.