Từ thượng nguồn, sông Nhuệ nhận nước thải của hàng trăm nhà máy, xí nghiệp, bệnh viện, nước thải sinh hoạt chưa qua xử lý xuôi về cuối nguồn. Với những xã nằm ở hạ lưu của sông Nhuệ như Hoàng Tây, Nhật Tựu, Nhật Tây, huyện Kim Bảng (Hà Nam) người dân đang gồng mình hứng chịu hậu quả. Đi kèm với ô nhiễm, bệnh tật cũng từ đó mà phát sinh.
