Sau khi vào cuộc điều tra, Công an tỉnh Thanh Hóa đã ra quyết định khởi tố vụ án hình sự xảy ra tại dự án Hạc Thành Tower (phường Điện Biên, TP Thanh Hóa) để điều tra về hành vi “lợi dụng chức vụ quyền hạn trong thi hành công vụ”.
Ngày 15/7, Phòng Cảnh sát Kinh tế (PC03, Công an tỉnh Thanh Hóa) đã ra quyết định khởi tố vụ án để điều tra về tội "lợi dụng chức vụ quyền hạn trong thi hành công vụ" xảy ra tại dự án Hạc Thành Tower (tại số 3, đường Phan Chu Trinh, phường Điện Biên, TP Thanh Hóa). Đây là khu "đất vàng" nằm ở vị trí đắc địa giữa lòng TP Thanh Hóa.
Liên quan tới vụ án này, nhằm ngăn chặn hành vi tẩu tán tài sản và thu hồi tài sản cho Nhà nước, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Thanh Hóa cũng đã có văn bản đề nghị Văn phòng đăng ký đất đai Thanh Hóa (thuộc Sở TN-MT) tra soát, cung cấp thông tin, tài liệu có liên quan đến 2 cá nhân để phục vụ điều tra.
Đồng thời, không thực hiện các thủ tục chuyển dịch quyền sử dụng đất và tài sản gắn liền với đất đối với 2 cá nhân này.
Theo đó, dự án Hạc Thành Tower được phê duyệt năm 2011, diện tích 0,3 ha, tại phường Điện Biên, TP Thanh Hóa, do Công ty CP Sông Mã làm chủ đầu tư.
Trước đó, vào tháng 3/1993, UBND tỉnh Thanh Hoá quyết định chuyển giao quỹ nhà ở thuộc sở hữu Nhà nước cho Công ty kinh doanh nhà Thanh Hóa quản lý và kinh doanh, với tổng diện tích hơn 7.400 m2. Vị trí khu đất thuộc khu nhà ở số 1, 2, và 3 đường Phan Chu Trinh.
Đến năm 2009, UBND tỉnh Thanh Hóa phê duyệt giá giao đất thu tiền sử dụng đất tại số 3 Phan Chu Trinh cho Công ty CP Sông Mã (đường Lê Hoàn, phường Ngọc Trạo, TP Thanh Hóa) để triển khai dự án đầu tư và khai thác.
Diện tích đất giao thu tiền sử dụng đất là 2.706 m2, với tổng số tiền sử dụng đất giao của cả khu đất mà Công ty CP Sông Mã phải nộp cho ngân sách Nhà nước là 56,826 tỷ đồng, tương ứng 21 triệu đồng/m2.
Đến năm 2013, dự án được UBND tỉnh Thanh Hóa điều chỉnh nâng diện tích đất của dự án Hạc Thành Tower từ hơn 2.706 m2 lên hơn 2.900 m2, nhưng tiền sử dụng đất Công ty Sông Mã phải nộp lại giảm từ hơn 56,826 tỷ đồng xuống hơn 48 tỷ đồng.
Năm 2013 Công ty CP Sông Mã mới hoàn tất việc điều chỉnh mặt bằng quy hoạch, và được bàn giao đất thực địa vào năm 2014. Tuy nhiên, từ năm 2012, UBND tỉnh Thanh Hóa đã có văn bản đồng ý cho Công ty CP Sông Mã chuyển quyền sử dụng đất đối với khu đất xây dựng tòa nhà hỗn hợp 15 tầng Hạc Thành Tower cho Công ty TNHH Huy Hoàng (chủ đầu tư cấp 2).