Báo cáo của Sở NNPTNT tỉnh Bà Rịa-Vũng Tàu cho biết, qua kết quả phân tích mẫu nước cho thấy, có sự ô nhiễm cục bộ tại vùng nuôi, trong đó có một số nguyên nhân dẫn tới tình trạng cá nuôi lồng bè trên sông Chà Và chết hàng loạt gồm: nước thải sinh hoạt của các hộ dân tại khu vực trên, lượng thức ăn cho cá dư quá nhiều.
Đáng chú ý, sau khi xảy ra tình trạng cá chết, người dân không xử lý đúng quy trình mà có hiện tượng vứt xác cá trên sông khiến môi trường nước càng thêm ô nhiễm và làm cá chết nhiều hơn. Phân tích mẫu cá chết cho thấy, không có mẫu nào nhiễm virut gây bệnh hoại tử thần kinh trên cá mà có sự xuất hiện của vi khuẩn Vibrio spp (vi khuẩn gây lở loét, xuất huyết trên cá).
Ngoài ra, do trời mưa nhiều làm giảm độ mặn cũng như hàm lượng ô-xi trong nước; số lượng nuôi dày đặc, cản trở lưu thông của dòng nước cũng có thể làm cá chết hàng loạt.
Vẫn theo Sở NNPTNT tỉnh này, có khoảng 241.000 con cá, tương đương gần 90 tấn cá của các hộ nuôi lồng bè ở Long Sơn bị chết trong đợt này.