UBTƯ MTTQ Việt Nam tổ chức Đại hội V (nhiệm kỳ 1999-2004), họp từ ngày 26 đến ngày 28/8/1999 tại Thủ đô Hà Nội). Đó là Đại hội chuyển tiếp từ thế kỷ XX sang thế kỷ XXI, là Đại hội “Phát huy tinh thần yêu nước, sức mạnh đại đoàn kết toàn dân, tăng cường Mặt trận Dân tộc Thống nhất, đẩy mạnh công nghiệp hóa, hiện đại hóa, xây dựng và bảo vệ Tổ quốc Việt Nam xã hội chủ nghĩa”. Tham dự Đại hội có 621 đại biểu chính thức và 138 đại biểu khách mời trong nước và quốc tế.