Cả cuộc đời gắn bó với phòng thí nghiệm, nghiên cứu về virút viêm não Nhật Bản, sốt xuất huyết, sởi, rubella, cúm, nghiên cứu phát triển các vắc - xin nhưng công trình để đời của GS Huỳnh Phương Liên chính là ứng dụng thành công công nghệ sản xuất vắc-xin viêm não Nhật Bản vào năm 1992. Với những đóng góp lớn lao đó, GS.TS Huỳnh Phương Liên được mọi người gọi bằng cái tên “Người sản xuất vắc – xin cho đất nước”.
