Bộ Công thương cũng thừa nhận, song song với đó cũng còn nhiều thách thức. Có thể kể tới một số mặt hàng nông sản mà Hoa Kỳ và một số nước khác trong TPP có thế mạnh, sức ép cạnh tranh là khá lớn khi thuế được đưa về 0%, trong đó nổi bật là các sản phẩm: thịt lợn, thịt gà hay như sữa, đậu tương, ngô….