Theo Thanh tra Chính phủ, trong nhiều nguyên nhân của những thiếu sót, khuyết điểm, vi phạm dẫn đến Dự án đầu tư xây dựng Phân hiệu Kiên Giang - Đại học Nha Trang chậm tiến độ, xảy ra nợ đọng xây dựng cơ bản nhưng đến nay chưa xử lý được phần lớn do chủ đầu tư thiếu trách nhiệm trong quản lý, thực hiện dự án; Bộ Giáo dục và Đào tạo (Bộ GDĐT) thiếu trách nhiệm trong việc thực hiện chức trách, nhiệm vụ của người quyết định đầu tư, buông lỏng công tác theo dõi, kiểm tra, giám sát, đánh giá dự án.
