Dự án Bảo tồn, tôn tạo và phát huy giá trị di tích lịch sử văn hóa chùa Bút Tháp được phê duyệt và triển khai một số hạng mục từ năm 2013. Cho đến cuối 2015, tu bổ nhiều hạng mục: tổng thể sân vườn, tam quan, gác chuông, tam bảo, nhà trung, phủ thờ, cổng phụ, nhà bia, hành lang, hậu đường. Ban chỉ đạo dự án vừa tiếp tục chỉ đạo đẩy nhanh tiến độ trùng tu, tôn tạo chùa để có thể hoàn thiện công trình trong thời gian sớm nhất.